En todas las series de videojuegos, anime y manga de Pokémon ha habido una organización que se opone a los protagonistas. Intentan robar Pokémon y despojar a la gente de su dinero, y algunas incluso intentan apoderarse del mundo. Esta es una lista de todas esas organizaciones.
Equipo Rocket
El Equipo Rocket es el sindicato del crimen de la región de Kanto y aparece en los juegos Pokémon Rojo, Azul y Verde, así como en sus remakes Rojo Fuego y Verde Hoja. También son el sindicato del crimen en la región de Johto y en los juegos Pokémon Oro, Plata y Cristal, así como en sus remakes HeartGold y SoulSilver.
El Equipo Rocket no aparece mucho en el anime, excepto por el dúo que trabaja para el Equipo Rocket, Jessie y James. Aparecen en casi todos los episodios del anime de Pokémon. Suelen idear un plan para capturar al Pikachu de Ash Ketchum, usando una gran máquina o tendiendo una trampa. El Team Rocket ha usado muchos disfraces como parte de sus planes. Cuando se dejan ver, suelen repetir su lema. Junto a este dúo, hay otros miembros del Team Rocket, como el otro dúo Butch y Cassidy, los rivales de Jessie y James. Todos sus intentos han fracasado, aunque la única excepción es en el anime de Pokémon Sol y Luna, donde derrotaron tanto al Pikachu de Ash como a Rowlet usando sus propios Mimikyu y Mareanie.
En el anime también aparecen otros miembros del Team Rocket, como el Doctor Zager, Matori, otros miembros menos notables del Team Rocket y el propio Giovanni.
El Equipo Rocket puede encontrarse en los juegos que tienen lugar en Kanto o Johto. Esto incluye Pokémon Rojo, Azul y Amarillo, y Pokémon Oro, Plata y Cristal. En Pokémon Amarillo, Jessie y James pueden encontrarse en 4 localizaciones durante el juego. El líder del Equipo Rocket, Giovanni, puede encontrarse en el Escondite Rocket, donde los jugadores deben derrotarlo para conseguir el Ámbito Silfo para la Torre Pokémon, donde los jugadores deben derrotarlo para salvar al Sr. Fuji y conseguir la Poké Flauta, en el último piso de la Silfo; donde los jugadores deben derrotarlo y conseguir la Master Ball como premio.
En la serie de manga Pokémon Aventuras Pokémon, Rojo encuentra y lucha contra el Equipo Rocket en muchos lugares, como el Monte Luna, el puerto Bermellón (donde llevaban a los Pokémon para viajar por mar), la Torre Lavanda y durante su toma de Ciudad Azafrán. En el manga, Blaine era un científico del Team Rocket que había combinado el ADN de Mew con el suyo propio, creando a Mewtwo. Sin embargo, él también adquirió el ADN de Mewtwo, por lo que ambos mantienen una estrecha relación. El manga también muestra a Koga, el Teniente Surge y Sabrina como miembros de alto rango del Team Rocket. Una diferencia importante entre el manga y otras versiones del Team Rocket es que varios líderes de gimnasio son villanos en el manga.
En el manga, Team Rocket es aparentemente un acrónimo de
«Incursión
En la
ciudad»,
Knock-out,
Evil
Tareas».
Equipo Aqua y Equipo Magma
El Equipo Aqua y el Equipo Magma son los dos sindicatos del crimen enfrentados en la región de Hoenn y en los juegos Pokémon Rubí, Zafiro y Esmeralda, así como en sus remakes Rubí Omega y Zafiro Alfa.
Los equipos Aqua y Magma no tuvieron mucho protagonismo en el anime. No son ladrones de Pokémon, pero sí lucharon entre ellos. El objetivo del Equipo Magma era evaporar los océanos y crear más tierra utilizable para las personas y los Pokémon, usando a Groudon para llevar a cabo sus planes. El objetivo del Equipo Aqua era inundar la tierra y crear más hábitats acuáticos para los Pokémon, utilizando para ello a Kyogre. Cuando los dos equipos se enfrentaron e intentaron utilizar sus Pokémon legendarios para derrotar al otro, el desastre natural resultante estuvo a punto de causar un incidente de destrucción masiva. Los equipos se disolvieron poco después.
Los agentes Aqua y Magma y sus líderes, Archie, líder de Aqua, y Maxie, líder de Magma, intervienen en Pokémon R/S/E. Hay que luchar contra los agentes para llegar hasta sus líderes. Archie y Maxie pueden ayudar en una batalla doble contra otros entrenadores, pero los jugadores también tienen que luchar contra ellos como líderes de sus equipos.
Equipo Galáctico
El Equipo Galáctico es el sindicato del crimen en la región de Sinnoh, que es el escenario de los videojuegos Pokémon Diamante y Perla. El equipo está liderado por un hombre llamado Cyrus, que creció en Ciudad Sunyshore y odiaba la compañía tanto de las personas como de los Pokémon, prefiriendo la compañía de las máquinas. El equipo tiene tres comandantes: Marte, Júpiter y Saturno. Su objetivo es crear un nuevo universo que puedan controlar. Muchos de los gruñidos no tienen ni idea del verdadero objetivo del Equipo Galáctico.
El Equipo Galáctico ha hecho varias apariciones en el anime. Han aparecido todos los comandantes y Cyrus. Su objetivo es similar al de los juegos. La cazadora del Equipo Galáctico, J, aparece en las series Diamante y Perla. Intenta congelar a los Pokémon en un estado similar a la piedra, para luego robarlos mientras están sin energía. Robó el Pikachu de Ash, el Meowth del Team Rocket y el Gardevoir de un entrenador, que fueron rescatados más tarde en el episodio. Gary y Ash se unieron para salvar a los cuatro Shieldon que J se estaba llevando.
En Diamante y Perla, secuestran al legendario Trío del Lago (Uxie, Mesprit y Azelf) y les quitan cristales para crear un objeto conocido como la Cadena Roja, que encadena y controla a un Pokémon, pero mantiene todo su poder. El jugador entra en el cuartel general de Galactic y derrota a Cyrus, así que éste deja que el jugador libere a los tres tras vencer a Saturno. En el Pilar de la Lanza, Cyrus usa la Cadena Roja para hacer salir a los Pokémon legendarios Dialga (en Diamante) o Palkia (en Perla), planeando usar su poder para crear el nuevo universo, sobre el que él será el nuevo líder. Sin embargo, el Trío del Lago regresa para suprimir el poder del legendario y romper la Cadena Roja, deteniendo a Cyrus. Tras esto, y el fracaso de Cyrus a la hora de derrotar al jugador, la mayor parte del Equipo Galáctico se marcha, incluido el propio Cyrus. Sólo quedan unos pocos en Veilstone City, liderados por Saturn, que ha decidido fundar un nuevo y mejor Team Galactic.
En Platino, sin embargo, el Equipo Galáctico planea conseguir los legendarios del tiempo y el espacio, lo que provoca la ira de Giratina, la tercera deidad de Sinnoh que representa las dimensiones, el caos y la muerte. El jugador tendrá que perseguir a Cyrus, ahora deseoso del poder de la antes desconocida Giratina, hasta una espeluznante dimensión conocida como Mundo Distorsión, en la que Giratina ha vivido durante muchas eras. Más adelante en el juego, se revela que Marte y Júpiter abandonaron el Equipo Galáctico. También aparece un nuevo miembro del Equipo Galáctico llamado Caronte, que es arrestado poco después de que Marte y Júpiter abandonaran.
Equipo Plasma
El Equipo Plasma es el equipo de villanos de la región de Unova. Aparece por primera vez en Blanco y Negro, pero también hace su aparición en la secuela posterior, Blanco y Negro 2. El objetivo original del Equipo Plasma era «liberar» a todos los Pokémon de sus entrenadores, ya fuera convenciéndoles para que liberaran a sus Pokémon o llevándoselos por la fuerza. Ghetsis, uno de los líderes del Equipo Plasma, explotó al grupo en un intento de gobernar Teselia como el único con Pokémon y formó el Neo Equipo Plasma. Dos años después de la derrota del Neo Equipo Plasma, el Equipo Plasma bueno regresó con un nuevo objetivo: gobernar Teselia. Un pequeño grupo del Equipo Plasma original seguía siendo leal a N, y se encargó de cuidar de los Pokémon debilitados en la naturaleza.
Equipo Llamarada
El Equipo Flare son los principales villanos de X/Y. Quieren rehacer el mundo a su imagen usando el poder de un Pokemon legendario. Fueron derrotados por los protagonistas.
Equipo Skull
Una banda de matones de la región de Alola. Liderados por Guzma. Roban Pokemon y Cristales Z de tipo Bicho.
Fundación Aether
Los verdaderos antagonistas de Sol/Luna. Liderados por Lusamine, querían robar y congelar Pokemon.
Equipo Yell
Otra banda de matones. Sigue a Marnie a todas partes.
Equipo Macro Cosmos
una compañía de energía Galar dirigida por el Presidente Rose cuyo objetivo es utilizar las inestables partículas rosas de galar en Dynamaxing como única fuente de energía para galar y tiene un plan secreto para encarcelar a un Pokemon para siempre conocido como El Día Más Oscuro que está hecho de Partículas de Galar para utilizarlo como energía, además las inestables partículas de galar provocan el desenfreno de los Pokemon.