Peranakan se refiere a la mezcla de chinos y malayos/indonesios. Muchos peranakan remontan sus orígenes a la Malaca del siglo XV.
Muchos peranakan de Java (Indonesia) descienden de chinos no musulmanes que se casaron con musulmanas javanesas abangan. La mayoría de los chinos no se convirtieron al islam porque sus esposas javanesas no se lo pidieron, pero una minoría de mujeres javanesas sí se lo pidieron, por lo que surgió entre los javaneses una comunidad musulmana china formada por conversos. A finales de la mitad del siglo XIX, los musulmanes javaneses se adhirieron más a las normas islámicas debido al hajj y a la llegada de más árabes a Java, ordenando la circuncisión de los conversos. En el siglo XIX, los musulmanes bátavos absorbieron por completo a los musulmanes chinos conversos, que a finales del siglo XVIII tenían su propio kapitán y comunidad. Los peranakanes chinos no musulmanes descendientes de hombres chinos y mujeres musulmanas javanesas dejaron de casarse con javaneses y los peranakaneses de élite dejaron de casarse con javaneses por completo y empezaron a casarse sólo con otros peranakanes chinos en el siglo XIX, al darse cuenta de que podían ser absorbidos por los musulmanes. Las pruebas de ADN realizadas a los chinos de Peranakan en Singapur demostraron que los Peranakan mezclados con malayos son en su mayoría descendientes de chinos Han por vía paterna y de malayos por vía materna.
Entre los descendientes de chinos del Estrecho (peranakan) en Sulu, Filipinas, se encuentra Abdusakur Tan II, el gobernador.